Klub został założony w 1967 roku przez grupę entuzjastów piłki nożnej, którzy chcieli stworzyć klub, który reprezentowałby Neapol, największe miasto w Grecji. Klub pierwotnie nazywał się AE Neapolis 1967, ale został później przemianowany na AE Neapolis.
Klub rozpoczął grę w lokalnej lidze, a w 1974 roku awansował do Gamma Ethniki, trzeciego poziomu greckiego systemu ligowego. AE Neapolis spędził wiele lat w Gamma Ethniki, aż w końcu w 1997 roku awansował do Beta Ethniki, drugiego poziomu greckiego systemu ligowego.
Klub spędził w Beta Ethniki sześć lat, zanim spadł z ligi w 2003 roku. AE Neapolis powrócił do Beta Ethniki w 2006 roku i spędził tam kolejne sześć lat, zanim spadł z ligi w 2012 roku.
AE Neapolis obecnie gra w Gamma Ethniki i jest jednym z najsilniejszych klubów w lidze. Klub ma silną bazę kibiców i jest znany ze swojej ofensywnej gry.
AE Neapolis jest również znany ze swojej akademii młodzieżowej, która wyprodukowała wielu utalentowanych piłkarzy, w tym Giorgosa Karagounisa, który grał w reprezentacji Grecji ponad 100 razy.
This website stores data such as cookies to enable site functionality including analytics and personalization. By
using this website, you automatically accept that we use cookies.